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Title:
T-CELL RECEPTOR BINDING TO MR1, AND USE THEREOF
Document Type and Number:
WIPO Patent Application WO/2021/250511
Kind Code:
A1
Abstract:
The present invention relates to a novel T-cell receptor binding to MR1, and a use thereof. Unlike a conventional customized anticancer immune T cell therapeutic agent, which are limitedly used depending on cancer type and the expression of cancer antigens according to human leukocyte antigen (HLA) type, T cells in which a T-cell receptor is expressed can be applied to all types of cancer regardless of HLA type.

Inventors:
KWON BYOUNG S (KR)
KIM YEONG CHEOL (KR)
KIM KWANGHEE (KR)
HWANG SUNHEE (KR)
CHUNG JIWON (KR)
LEE JUNGYUN (KR)
Application Number:
PCT/IB2021/054848
Publication Date:
December 16, 2021
Filing Date:
June 03, 2021
Export Citation:
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Assignee:
EUTILEX CO LTD (KR)
International Classes:
C07K14/705; A61K35/17; A61P35/00; C07K16/18; C12N5/0783
Domestic Patent References:
WO2019081902A12019-05-02
WO2020053312A12020-03-19
Foreign References:
KR20200064126A2020-06-05
Other References:
DATABASE PROTEIN 6 February 2020 (2020-02-06), ANONYMOUS: "T-cell receptor alpha chain, partial [Homo sapiens]", XP055878546, retrieved from GENBANK Database accession no. QHN70739
DATABASE PROTEIN 20200206; ANONYMOUS: "T cell receptor beta chain, partial [Homo sapiens]", XP055878554, retrieved from GENBANK Database accession no. QHN70740
CROWTHER MICHAEL D.; DOLTON GARRY; LEGUT MATEUSZ; CAILLAUD MARINE E.; LLOYD ANGHARAD; ATTAF MERIEM; GALLOWAY SARAH A. E.; RIUS CRI: "Genome-wide CRISPR–Cas9 screening reveals ubiquitous T cell cancer targeting via the monomorphic MHC class I-related protein MR1", NATURE IMMULOGY, vol. 21, no. 2, 20 January 2020 (2020-01-20), New York , pages 178 - 185, XP037525542, ISSN: 1529-2908, DOI: 10.1038/s41590-019-0578-8
Attorney, Agent or Firm:
LEE, Cheo Young et al. (KR)
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Claims:
【청구범위】

【청구항 1】 서열번호 3, 5, 8, 9 및 13로 구성된 군에서 선택된 00113 및 서열번호 2, 4, 6, 7, 10, 11 및 12로 구성된 군에서 선택된 00113욘를 포함하는, MR1 (MHC class I related protein)에 결합하는 T-세포 수용체 (T cell receptor).

【청구항 2】 제 1항에 있어서, 다음을 포함하는 세포 수용체: 서열번호 3의 00113 & 및 서열번호 4의 00113욘 ; 서열번호 5의 00113 & 및 서열번호 6의 00113욘 ; 서열번호 1의 00113 & 및 서열번호 7의 00113욘 ; 서열번호 8의 00113 & 및 서열번호 2의 00113욘 ; 서열번호 9의 00113 & 및 서열번호 10의 00113욘 ; 서열번호 3의 00113 & 및 서열번호 11의 00113욘 ; 서열번호 3의 00113 & 및 서열번호 12의 00113욘 ; 또는 서열번호 13의 00113 & 및 서열번호 4의 00113욘 .

【청구항 3】 제 1항에 있어서, 서열번호 14, 16, 18,20,22,24,26,28 및 30으로 구성된 군에서 선택되는 & 체인을 포함하는 세포 수용체. 【청구항 4】 제 1항에 있어서, 서열번호 15, 17, 19,21,23,25,27,29 및 31으로 구성된 군에서 선택되는 ^ 체인을 포함하는 세포 수용체.

【청구항 5】 2021/250511 ?01/162021/054848 제 1항 내지 제 4항 중 어느 한 항에 따른 1-세포 수용체를 코딩하는 핵산. 【청구항 6】 제 5항에 있어서, 서열번호 32 내지 49로 구성된 군에서 선택되는 서열을 포 함하는 핵산. 【청구항 7】 제 5항의 핵산이 클로닝된 벡터 .

【청구항 8] 제 1항 내지 제 4항 중 어느 한 항에 따른 1-세포 수용체를 발현하는, I세포. 【청구항 9] 제 8항에 있어서 , 008 양성인, I세포.

【청구항 10】 제 1항 내지 제 4항 중 어느 한 항에 따른 ᅡ세포 수용체, 제 5항의 핵산, 제 7항 의 벡터 또는 제 8항의 I세포를 포함하는 항-종양 또는 항암 조성물.

Description:
에 결합하는 ᅡ세포 수용체 및 이의 용도 발명의 분야 본 발명은 MR1 (MHC Class I Related Protein)에 결합하는 신규 T-세포 수용체 및 이의 용도, 예를 들어 종양 또는 암의 면역치료 용도에 관한 것으로, 상기 T-세포 수용체를 발현하는 T-세포는 암종 및 HLA (Human Leukocyte Antigen) 유형에 따른 암 항원의 발현에 따라 제한적으로 사용되는 기존 맞춤형 항암면역 T 세포치료제와 달 리, HLA 유형에 상관없이 모든 암종에 적용 가능하다. 배경기술 현재 T 세포를 기반으로 하는 대부분의 항암면역세포치료제의 경우 개개인의

HLA 유형이 나타내는 이질성 때문에 각 환자에만 맞춤형치료제로 그 사용이 제한 적이며, 특정 암항원을 발현하는 암종에 대해서만 치료제의 사용이 가능한 상황이 다. 일부 동종의 항암면역세포치료제 (allogenic T cell)의 개발 및 임상적인 접근이 고려되고 있으나, 이를 위해서는 유전자 조작이 필수적이어서 효력 뿐 아니라 안전 성이 담보되어야 하며, 개발되는 대부분의 동종의 유전자 변형 T 세포 예를 들어, 동종 CAR T세포 (allogenic CAR T cell) 및 T-세포 수용체 가공 T세포 (TCR-engineered T cell)의 경우 종양 (특히, 고형암)을 공격하기 위한 수용체 다양성 (TCR diversity)이 부 족하여, 제한적인 항암효력을 발휘하거나 암의 회피나 재발에 취약할 수 있다. 따라서, HLA 유형에 따른 암항원의 발현 및 암종에 상관없이 암을 치료하기 위해 사용할 수 있는 수용체 다양성이 풍부한 T 세포 치료제를 개발할 필요가 있다. 더 나아가 이들 T 세포에서 HLA의 조작은 모든 암환자에게 사용 가능한 동종의 T 세포치료제로 사용될 수 있다. 종래의 T 세포는 MHC (major histocompatibility complex) 분자에 의해 제공되는 펩타이드 항원 (peptideAg)을 인지하는 T 세포 수용체 (TCR)와 결합한다. 그러나 최근 개발된 T 세포는 단형성 MHC 클래스 I 유사 항원 제시 분자 (monomorphic MHC class I-like Ag(Antigen)-presenting molecules)에 의해 제공되는 비펩타이성 항원 (nonpeptidic Ag)을 인지하며, MR1 (MHC class I related protein)이 비펩타이성 항원을 T 세포에 제공할 수 있는 능력을 가지는 중요한 MHC 클래스 I 유사 항원 제시 분자 로 알려져 있다 (Nature Reviews Immunology volume 20, pagel41 (2020)).

MR1 분자는 대부분의 포유동물 종 사이에서 고도로 보존된 (highly conserved) 비 -다형성 , 비 -고전적 MHC 분자 (non-polymorphic, non-classical MHC molecule)이다. 개 개인에서 다양성을 가지는 HLA와는 달리, 대부분의 암세포 표면에 발현되는 단일 HLA 유사 분자 (single HLA-like molecule)인 MR1에 결합하는 고유의 TCR (unique TCR) 을 가진 T 세포는 정상세포를 인지하지 못하고 암세포에서 발현하는 MR1에 결합하 여 암세포만을 선택적으로 공격할 수 있다. 이러한 발견은 인간 집단 (human population)에 대하여 다양성을 가지지 않는 HLA 독립적이고, 암종에 영향을 받지 않으며, 환자군에 영향이 없는 (HLA- independent, pan-cancer, pan-population) 면역치료법을 구현할 수 있는 기회를 제공할 수 있다.

MR1에 대한 TCR과 관련하여, 국제공개특허 제 WO 2018/162563호는 암세포의 MR1 에 결합하는 TCR 발현 T세포의 분리방법을 개시한다. 또한, 국제공개특허 제 WO 2020/053312호는 암세포의 MR1에 결합하는 TCR발현 T세포 제조방법을 개시한 다. 더욱이, 국제공개특허 제 WO2019/081902호는 특정 CDR 서열을 포함하는 MR1 TCR을 개시한다. 이러한 기술적 배경하에서, 본 출원의 발명자들은 T-세포 수용체를 발현하는 T-세포는 암종 및 HLA (Human Leukocyte Antigen) 유형에 따른 암항원의 발현에 따라 제한적으로 사용되는 기존 맞춤형 항암면역 T 세포치료제와 달리, HLA 유형에 상관 없이 모든 암종에 적용 가능한 MR1에 결합 가능한 신규 T-세포 수용체 및 이의 용 도를 확인함으로써 , 본 발명을 완성하였다. 발명의 요약 본 발명의 목적은 MR1 (MHC class I related protein)에 결합하는 신규 T-세포 수 용체 (T cell receptor)을 제공하는데 있다. 본 발명의 목적은 상기 T-세포 수용체를 코딩하는 핵산을 제공하는데 있다. 본 발명의 목적은 상기 핵산이 클로닝된 벡터를 제공하는데 있다. 본 발명의 목적은 상기 T-세포 수용체를 발현하는 T 세포를 제공하는데 있 다. 본 발명의 목적은 상기 T-세포 수용체, 핵산, 벡터 또는 T 세포를 포함하는 항-종양 또는 항암 조성물을 제공하는데 있다. 상기 목적을 달성하기 위하여 , 본 발명은 서 열번호 2 내지 13으로 구성된 군 에서 선택된 하나 이상의 CDR3를 포함하는, MR1 (MHC class I related protein)에 결합하 는 T-세포 수용체 (T cell receptor)를 제공한다. 본 발명은 상기 T-세포 수용체를 코딩하는 핵산을 제공한다. 본 발명은 상기 핵산이 클로닝된 벡터를 제공한다. 본 발명은 상기 T-세포 수용체를 발현하는 T 세포를 제공한다. 본 발명은 상기 T-세포 수용체, 상기 핵산, 상기 벡터 또는 상기 T 세포를 포 함하는 항-종양 또는 항암 조성물을 제공한다. 도면의 간단한 설명 도 1은 MR1 제한적 암 살상 CD8+ T 림프구의 구체적 분리 및 대량 배양 방 법을 나타낸 모식도이다. 도 2는 인간 흑색종 (A375), 유방암 (SKOV-3), 대장암 세포주 (SW480, HCT- 15) 등에서 MR1이 낮은 수준으로 발현됨을 확인한 결과를 나타낸 것이다. 도 3 a 및 도 3 b는 증식 다이 (Proliferation dye) 기반으로 MR1-제한적 T 세포 (MR1 -restricted T cell)를 분리 및 증식한 결과를 나타낸 것이다. 도 4a는 선별된 MR1 제한적 T 세포는 MAIT 세포가 아님을 확인한 결과를 나타낸 것이다. 도 4b는 MR1 제한적 T 세포에서 4 - 1BB 발현을 확인한 결과를 나타낸 것이다. 도 5는 CD8 양성 T 세포의 구체적 구조를 나타낸 모식도이다. 도 6은 범용 암에 대한 살상능을 가지는 CD8 양성 T 세포를 생산하는 플랫폼 기술에 대한 모식도이다. 도 7은 MR1 TCR 렌티바이 러스 플라스미드의 구조를 나타낸 것이다. 도 8은 MR1 TCR 렌티바이러스 플라스미드 클로닝을 위한 벡터 백본 (vector backbone)의 구조를 나타낸 것이다. 도 9는 MR1 TCR 렌티바이러스 플라스미드 형질감염 플라스미드 클로닝 결과를 나타낸 것이다. 도 10은 Jurkat-NFAT-Luciferase에서의 TCR 발현을 확인한 결과를 나타낸 것이다. 도 11은 MR1 활성화에 의한 기능 분석 (functional assay) 결과를 나타낸 것이다. 발명의 상세한 설명 및 바람직한 구현예 다른 식으로 정의되지 않는 한, 본 명세서에서 사용된 모든 기술적 및 과학 적 용어들은 본 발명이 속하는 기술분야에서 숙련된 전문가에 의해서 통상적으로 이해되는 것과 동일한 의미를 갖는다. 일반적으로, 본 명세서에서 사용된 명명법은 본 기술분야에서 잘 알려져 있고 통상적으로 사용되는 것이다. 본 발명은 일 관점에서 본 발명은 서열번호 2 내지 13으로 구성된 군에서 선 택된 하나 이상의 CDR3를 포함하는, MR1 (MHC class I related protein)에 결합하는 T-세 포 수용체 (T cell receptor)에 관한 것이다. 본 발명은 구체적으로, 서열번호 3, 5, 8, 9 및 13로 구성된 군에서 선택된 CDR3 a ; 및 서열번호 2, 4, 6, 7, 10, 11 및 12로 구성된 군에서 선택된 CDR3욘를 포함한다. 본 발명에서 용어 T-세포 수용체 (TCR)은 TCR 또는 기능적 단편 및 그 폴리 펩티드에 관한 것으로, 가변 (V), [다양성 (D),] 연결 (J) 및 불변 (C)으로 지정되는 도메인 들의 고유한 조합으로 구성된 체인을 포함한다. TCR a 체인 및 P 체인의 세포의 기능적 단편들, 예를 들어 이황화 결합에 의해 연계되지만 막횡단 및 세포질 (cytosolic) 도메인이 결여된 것을 포함할 수 있다. T 세포 클론에서, a 및 욘 체인 또는 6 및 Y 체인의 D 및 J 도메인에 대한 조합이 T 세포 클론의 고유한 특성에 따른 방식으로 항원 인식에 참여하며 T 세포 클론의 개별 특이형으로 알려진 고유한 결합 부위를 정의한다. 이와 반대로, C 도메인은 항원 결합에 참여하지 않는다. 본 발명에 따른 T-세포 수용체는 하나 이상의 TCR a 및/또는 TCR p 가변 도 메인을 포함할 수 있다. 가변 도메인에 TCR a 가변 도메인과 TCR p 가변 도메인이 포함될 수 있다. 본 발명에 따른 T-세포 수용체는 하나 이상의 TCR a 및/또는 TCR p 불변 도메인을 포함할 수 있다. 본 발명에 따른 T-세포 수용체는 TCR a의 가변 도메인 및 불변 도메인을 포 함하는 제 1폴리펩티드 및/또는 TCR p 체인의 가변 도메인 및 불변 도메인을 포함하 는 제 2폴리펩티드를 포함할 수 있다. 예를 들어, ap 이질이합체일 수 있거나, 단일 체인 형태일 수 있다. ap TCR은 예를 들어 세포질 도메인 및 막횡단 도메인을 모두 갖는 전장 체인을 포함할 수 있다. 경우에 따라서, 불변 도메인의 잔기 사이에 도입 된 이황화 결합이 존재할수 있다 . 본 발명에 따른 T-세포 수용체는 불변성 CD3 체인 분자와 결합하여 완전한 기능성 TCR을 형성하는 고가변성 알파 (a) 및 베타 (故 체인으로 이루어진 디설파이드

-결합된 막-고정된 이종이량체성 단백질이다. a-P 이종이합체 TCR은 하나의 a 체 인 및 하나의 P 체인을 갖는다. 각 체인은 가변, 경우에 따라서 결합 및 불변 영역 을 포함하며, P 체인은 또한 대개 가변 및 결합 영역 사이에 짧은 다양성 영역을 포함하지만, 이 다양성 영역은 흔히 결합 영역의 일부로서 간주된다. 각 가변 영역 은 구조틀서열에 포매되어 있는 세 개의 CDR (상보성 결정 영역)을 포함하며, 그 중 하나는 CDR3로 정의된 과가변영역이다. 여러 유형의 a 체인 가변 (Va) 영역, 여러 유형의 욘 체인 가변 (VP) 영역을 포함하고, CDR1 및 CDR2 및/또는 CDR3 서열에 의해 구별된다. a 체인 가변 (Va) 영역의 CDR1 내지 CDR3는 각각 CDRla, CDR2 a 및 CDR3a로 표시되고, 욘 체인 가변 (VP) 영역의 CDR1 내지 CDR3는 각각 CDR1 13 , CDR2|3 및 CDR3 로 표시된다. IMGT (international ImMunoGeneTics information system®) 명명법에서 V a 유형은 고유한 TRAV번호로 지칭하고, V|3 유 형은 고유한 TRBV숫자로 지칭한다. 본 발명에 따른 T-세포 수용체는 aPTCR로 aPTCR의 세포외 부분은 각각 2개의 폴리펩티드로 구성되며, 이들 각각은 막 근위의 불변 도메인과 막 원위의 가 변 도메인을 갖는다. 불변 및 가변 도메인 각각은 체인내 이황화 결합을 포함한다. 가변 도메인은 항체의 상보성 결정 영역 (CDR)과 동족인 고도로 다형태적인 루프를 포함한다. 본 발명의 T-세포 수용체는 서열번호 2 내지 13으로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 CDR3를 포함한다. 구체적으로, 본 발명은서열번호 3,5, 8,9 및 13의 a 체인 CDR3 또는서열번호 2,4,6,7,10,11 및 12의 욘 체인 CDR3를 포함할수 있다. 더욱 구체적으로, 본 발명의 T-세포수용체는 다음을 포함할수 있다: 2021/250511 ?01/162021/054848 서열번호 3의 00113 & 및 서열번호 4의 00113욘 ; 서열번호 5의 00113 & 및 서열번호 6의 00113욘 ; 서열번호 1의 00113 & 및 서열번호 7의 00113욘 ; 서열번호 8의 00113 & 및 서열번호 2의 00113욘 ; 서열번호 9의 00113 & 및 서열번호 10의 00113욘 ; 서열번호 3의 00113 & 및 서열번호 11의 00113욘 ; 서열번호 3의 00113 & 및 서열번호 12의 00113욘 ; 또는 서열번호 13의 00113 & 및 서열번호 4의 00113욘 . 본 발명에 따른 세포 수용체는 막 근위의 불변 도메인과 막 원위의 가변 도메인을 포함하는 a 체인 및 욘 체인을 포함할 수 있다. 본 발명에 따른 ᅡ세포 수용체는 서열번호 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28 및 30으 로 구성된 군에서 선택되는 & 체인을 포함할 수 있다. 본 발명에 따른 세포 수용 체는 서열번호 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27, 29 및 31으로 구성된 군에서 선택되는 욘 체인 을 포함할 수 있다. 구체적으로, 본 발명에 따른 1-세포 수용체는 다음의 & 체인 및 ^ 체인을 포함할 수 있다: 서열번호 14의 & 체인 및 서열번호 15의 욘 체인; 서열번호 16의 & 체인 및 서열번호 17의 욘 체인; 서열번호 18의 & 체인 및 서열번호 19의 욘 체인; 서열번호 20의 & 체인 및 서열번호 21의 욘 체인; 서열번호 22의 & 체인 및 서열번호 23의 욘 체인; 서열번호 24의 & 체인 및 서열번호 25의 욘 체인; 서열번호 26의 & 체인 및 서열번호 27의 욘 체인; 서열번호 28의 & 체인 및 서열번호 29의 욘 체인; 또는 서열번호 30의 & 체인 및 서열번호 31의 욘 체인. 경우에 따라서, 본 발명에 따른 T-세포 수용체는 단일 체인 형태로도 포함될 수 있다. TCR 체인은 제 1폴리펩티드 a 체인 및 두 번째 제 2폴리펩티드 P 체인을 포 함할 수 있다. 상기 a 체인 및 욘 체인은 다음을 포함할 수 있다: 서열번호 14의 a 체인 및 서열번호 15의 P 체인; 서열번호 16의 a 체인 및 서열번호 17의 P 체인; 서열번호 18의 a 체인 및 서열번호 19의 P 체인; 서열번호 20의 a 체인 및 서열번호 21의 P 체인; 서열번호 22의 a 체인 및 서열번호 23의 P 체인; 서열번호 24의 a 체인 및 서열번호 25의 P 체인; 서열번호 26의 a 체인 및 서열번호 27의 P 체인; 서열번호 28의 a 체인 및 서열번호 29의 욘 체인; 또는 서열번호 30의 a 체인 및 서열번호 31의 욘 체인. 상기 단일 체인은 2개 이상의 폴리펩티드를 함께 연결하는 하나 이상의 링커를 임의적으로 포함할 수 있다. 링커는 예를 들어 펩타이드일 수 있다. 상기 링커는 펩타이드 링커일 수 있으며, 약 10-25 aa 길이를 가질 수 있다. 예를 들어, 글리신 및/또는 세린과 같은 친수성 아미노산이 포함될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 구체적으로, 상기 링커는 예를 들어, (GS)n, (GGS)n, (GSGGS)n 또는 (GnS)m (n, m은 각각 1 내지 10)을 포함할 수 있으나, 상기 링커는 예를 들어 (GnS)m (n, m은 각각 1 내지 10)일 수 있다. 구체적으로, 상기 링커는 GGGGS를 포함할 수 있다. 본 발명의 T-세포 수용체는 MR1 (MHC class I related protein)을 특이적으로 인식할 수 있는 범위 내에서, 본 명세서에 기재된 T-세포 수용체의 서열뿐만 아니라, 이의 생물학적 균등물도 포함할 수 있다. 예를 들면, T-세포 수용체의 결합 친화도 및/또는 기타 생물학적 특성을 보다 더 개선시키기 위하여 아미노산 서열에 추가적인 변화를 줄 수 있다. 이러한 변형은 예를 들어, 아미노산 서열 잔기의 결실, 삽입 및/또는 치환을 포함한다. 이러한 아미노산 변이는 아미노산 곁사슬 치환체의 상대적 유사성, 예컨대, 소수성, 친수성, 전하, 크기 등에 기초하여 이루어진다. 아미노산 곁사슬 치환체의 크기 , 모양 및 종류에 대한 분석에 의하여 , 아르기닌, 라이신과 히스티딘은 모두 양전하를 띤 잔기이고; 알라닌, 글라이신과 세린은 유사한 크기를 가지며 ; 페닐알라닌, 트립토판과 타이로신은 유사한 모양을 갖는다는 것을 알 수 있다. 따라서, 이러한 고려 사항에 기초하여, 아르기닌, 라이신과 히스티딘; 알라닌, 글라이신과 세린; 그리고 페닐알라닌, 트립토판과 타이로신은 생물학적으로 기능 균등물이라 할 수 있다. 상술한 생물학적 균등 활성을 갖는 변이를 고려한다면, 본 발명의 T-세포 수용체는 서열번호에 기재된 서열과 실질적인 동일성 (substantial identity)을 나타내는 서열도 포함하는 것으로 해석된다. 상기의 실질적인 동일성은, 상기한 본 발명의 서열과 임의의 다른 서열을 최대한 대응되도록 얼라인하고, 당업계에서 통상적으로 이용되는 알고리즘을 이용하여 얼라인된 서열을 분석한 경우에, 최소 90%의 상동성, 가장 바람직하게는 최소 95%의 상동성, 96% 이상, 97% 이상, 98% 이상, 99% 이상의 상동성을 나타내는 서열을 의미한다. 서열비교를 위한 얼라인먼트 방법은 당업계에 공지되어 있다. NCBI Basic Local Alignment Search Tool(BLAST)은 NBCI 등에서 접근 가능하며, 인터넷 상에서 blastp, blasm, blastx, tblastn 및 tblastx와 같은 서열 분석 프로그램과 연동되어 이용할 수 있다. BLAST는 www.ncbi.nlm. nih.gov/BLAST/에서 접속 가능하다. 이 프로그램을 이용한 서열 상동성 비교 방법은 www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/blast_ help.html에서 확인할 수 있다. 이에 기초하여, 본 발명의 T-세포 수용체는 명세서에 기재된 명시된 서열 또는 전체와 비교하여 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 그 이상의 상동성을 가질 수 있다. 이러한 상동성은 당업계에 공지된 방법에 의한 서열 비교 및/또는 정렬에 의해 결정될 수 있다. 예를 들어, 서열 비교 알고리즘 (즉, BLAST 또는 BLAST 2.0), 수동 정렬, 육안 검사를 이용하여 본 발명에 따른 단백질의 퍼센트 서열 상동성을 결정할 수 있다. 본 발명에 따른 T-세포 수용체는 비-다형성 MHC I-관련 MR1 항원-제시 분자 에 결합하는 T 세포 수용체 단백질로, 종양 또는 암세포 상에서 발현되어 종양 또는 암 관련 항원을 제시하는 MR1 분자에 결합한다. 본 발명에서 용어 MR1 분자에 결 합하는 T-세포 수용체를 포함하는 세포는 MR1 제한적 T-세포로도 명명된다. 본 발명에 따른 T-세포 수용체는 종양 또는 암 치료를 위해 T 세포에 대해

MR1-발현 종양 또는 암세포를 특이적으로 인식하기 위해 사용될 수 있다. MR1-발현 종양 또는 암세포 (종양 또는 암 항원을 MR1-제한된 방식으로 제시함)에 접촉시, 활 성화되어 반응성을 나타낸다. 본 발명은 다른 관점에서, 상기 T-세포 수용체를 코딩하는 핵산에 관한 것이다. 본 발명의 T-세포 수용체을 코딩하는 핵산을 분리하여 T-세포 수용체를 재조합적으로 생산할 수 있다.

’’핵산’’은 DNA(gDNA 및 cDNA) 및 RNA 분자를 포괄적으로 포함하는 의미를 가지며, 핵산에서 기본 구성단위인 뉴클레오타이드는 자연의 뉴클레오타이드 뿐만 아니라, 당 또는 염기 부위가 변형된 유사체 (analogue)도 포함한다. 본 발명의 중쇄 및 경쇄 가변영 역을 코딩하는 핵산의 서열은 변형될 수 있다. 상기 변형은 뉴클레오타이드의 추가, 결실, 또는 비보존적 치환 또는 보존적 치환을 포함한다 . 이에 기초하여, 본 발명의 T-세포 수용체은 명세서에 기재된 명시된 서열 또는 전체와 비교하여 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 또는 그 이상의 상동성을 가질 수 있다. 이러한 상동성은 당업계에 공지된 방법에 의한 서 열 비교 및/또는 정렬에 의해 결정될 수 있다. 예를 들어, 서열 비교 알고리즘 (즉, BLAST 또는 BLAST 2.0), 수동 정렬, 육안 검사를 이용하여 본 발명의 핵산 또는 단백질의 퍼센트 서열 상동성을 결정할 수 있다 . 상기 T-세포 수용체을 코딩하는 핵산은 서열번호 32 내지 49로 구성된 군에서 선택되는 핵산을 포함할 수 있다 . 본 발명에 따른 구체적 실시 예에서, 다음을 포함할 수 있다: 서열번호 32의 a 체인 코딩 핵산 및 서열번호 33의 P 체인 코딩 핵산; 서열번호 34의 & 체인 코딩 핵산 및 서열번호 35의 욘 체인 코딩 핵산; 서열번호 36의 & 체인 코딩 핵산 및 서열번호 37의 욘 체인 코딩 핵산; 서열번호 38의 & 체인 코딩 핵산 및 서열번호 39의 욘 체인 코딩 핵산; 서열번호 40의 & 체인 코딩 핵산 및 서열번호 41의 욘 체인 코딩 핵산; 서열번호 42의 & 체인 코딩 핵산 및 서열번호 43의 욘 체인 코딩 핵산; 서열번호 44의 & 체인 코딩 핵산 및 서열번호 45의 욘 체인 코딩 핵산; 서열번호 46의 a 체인 코딩 핵산 및 서열번호 47의 욘 체인 코딩 핵산; 또 서열번호 48의 a 체인 코딩 핵산 및 서열번호 49의 ^ 체인 코딩 핵산. 상기 1-세포 수용체를 코딩하는 DNA는 통상적인 분자생물학적 수법을 사용하여 (예를 들어, 세포 수용체를 코딩하는 DNA와 특이적으로 결합할 수 있는 올리코뉴클레오타이드 프로브를 사용함으로써) 용이하게 분리 또는 합성할 수 있으며, 핵산을 분리하고, 이를 복제 가능한 벡터 내로 삽입하여 추가로 클로닝하거나(DNA의 증폭) 또는 추가로 발현시킨다. 이를 바탕으로, 본 발명은 또 다른 관점에서 상기 핵산을 포함하는 재조합 벡터에 관한 것이다. 본 명세서에서 사용되는 용어, ’’벡터 ’’는 핵산 분자로서 연결된 또 다른 핵산을 수송할 수 있는 핵산 분자를 지칭한다. 예를 들어, 단일-가닥, 이중-가닥 또는 부분적 이중-가닥인 핵산 분자; 하나 이상의 자유 말단, 비 자유 말단(예를 들어, 환형)을 포함하는 핵산 분자; 둘 모두를 포함하는 핵산 분자; 및 당업계에 공지된 다른 다양한 폴리뉴클레오티드를 포함한다. 예를 들어, 상기 벡터는 "플라스미드’’이며, 환형의 이중 가닥 DNA 루프를 지칭하는 것으로서, 여기에 예컨대, 표준 분자 클로닝 기법에 의해 추가적인 DNA 세그먼트가 삽입될 수 있다. 예를 들어, 바이러스 벡터를 포함할 수 있다. 상기 바이러스 벡터는 예를 들어, Lenti viral Vector(LV) 또는 Retix)viral Vector(RV)를 포함할 수 있다.

LV는 Retrovirus ssRNA를 유전물질로 포함하며 약 ~8 此의 패키징 용량을 2021/250511 1^(:1^2021/054848 가진다. LV를 통해 외부 유전자를 희석없이 dividing cells에 형질감염시킬 수 있다. LV는 dividing cell 및 non-dividing cell 모두 형질감염 가능하다. Transfer Vector, Packaging Vector 및 Envelope Vector를 포함하고, 3개의 vector를 co-transfection 시켜, 바이러스 입자 생성 후 정량-정제하여 목적하는 유전자가 잘 전달된 세포를 선별할 수 있다. 상기 tmnsfer vector는 Tat (유전자 발현 위한 전사 유도 단백질) binding site인 5’ LTR 및 3, LTR, packaging signal(\ |/ ) 및 도입유전자를 포함할 수 있다. 상기 packaging vector는 복제성이 제거된 packaging signal(A\|/)이 결실되고, capsid, reverse transcriptase, protease, integrase 등과 같은 효소가 발현되는 gag 및/또는 p이과 같은 바이러스 구조 유전자를 포함할 수 있다. Transcription을 유도하는 Tat 및/또는 mRNA를 수송하기 위한 Rev와 같은 바이러스 조절 유전자 (tat 및/또는 rev)를 포함할 수 있다. 상기 envelope vector는 바이러스 envelope 발현 유전자인 viral env를 포함할 수 있다.

RV와 관련하여, 유전 정보 가지는 RNA가 역전사 효소에 의해 이중가닥의 DNA 로 전환된 provirus DNA 통해 복제 개시된다. 약 〜 8此의 외부 유전자 도입이 가능하다. LTR 포함 치료유전자가 도입된 플라스미드를 바이러스 입자화 세포주에 도입하여 바이러스 입자 제조할 수 있다. 세포주는 gag, pol, env 단백질을 공급한다.

Transfer Vector, Packaging Vector 및 Envelope Vector를 포함하고 , 3개의 vector를 co-transfection 시켜 , 바이러스 입자 생성 꾸 정량-정제하여 목적하는 유전자가 잘 전달된 세포를 선별할 수 있다. 상기 tmnsfer vector는 Tat (유전자 발현 위한 전사 유도 단백질) binding site인 5’

LTR, 3, LTR, 및 도입유전자를 포함할 수 있다. 5, LTR 및 3, LTR* 통해 바이러스 복제, 숙주로의 삽입, 바이러스 유전자 발현을 유도한다. 상기 packaging vector는 복제성이 제거된 packaging signal (A\|/)°] 결실되고, capsid, reverse transcriptase, protease, integrase 등과 같은 효소가 발현되는 gag 및/또는 p이과 같은 바이러스 구조 유전자를 포함할 수 있다. 바이러스 envelope 발현 유전자인 viral env를 포함할 수 있다. 2021/250511 ?01/162021/054848 바이러스 벡터의 경우, 바이러스-유도된 DNA 또는 묘 쇼 서열은 바이러스(예를 들어, 레트로바이러스, 복제 결함 레트로바이러스, 아데노바이러스, 복제 결함 아데노바이러스, 및 아데노-관련 바이러스)에서는 바이러스 내로 패키징하기 위한 벡터에 존재한다. 바이러스 벡터는 숙주세포 내로의 형질감염을 위한 바이러스에 의해 운반된 폴리뉴클레오티드를 포함한다. 경우에 따라서, 벡터는 도입되는 숙주세포에서 자율 복제할 수 있다(예를 들어, 박테리아 복제 갖는 박테리아 벡터 및 에피솜 포유류 벡터). 기타 벡터(예를 들어, 비-에피솜 포유동물 벡터)는 숙주세포 내로 도입시 숙주세포의 게놈으로 통합되어, 이에 의해 숙주 게놈과 함께 복제된다. 특정 벡터는 이들이 작동 가능하게 연결된 유전자의 발현을 지시할 수 있다 . 이러한 벡터는 본원에서 "발현 벡터”로 지칭된다. 재조합 DNA 기술에서 유용한 일반적인 발현 벡터는 종종 플라스미드 형태이다. 재조합 발현 벡터는 숙주세포에서 핵산의 발현에 적합한 형태로 핵산을 포함할 수 있으며, 이는 재조합 발현 벡터가 발현을 위해 사용되도록 즉, 발현될 핵산 서열에 작동 가능하게-연결되도록 숙주세포를 기반을 선택될 수 있는 하나 이상의 조절 요소를 포함함을 의미한다. 재조합 발현 벡터 내에서, "작동 가능하게 연결된’’은 관심 뉴클레오티드 서열이 뉴클레오티드 서열의 발현을 허용하는 방식으로(예를 들어, 시험관내 전사/번역 시스템에서 또는 벡터가 숙주세포 내로 도입되는 경우 숙주세포에서) 조절 요소에 연결됨을 의미한다.

"조절 요소”는 프로모터, 인핸서, 내부 리보솜 진입 부위(11犯¾ 및 기타 발현 조정 요소(예를 들어, 전사 종결 신호 예컨대, 폴리아데닐화 신호 및 폴리- II 서열)을 포함할 수 있다. 조절 요소는 많은 유형의 숙주세포에서 뉴클레오티드 서열의 유도 또는 항상 발현을 지시하는 요소 및 특정 숙주세포에서만 뉴클레오티드 서열의 발현을 지시하는 요소(예를 들어, 조직-특이적 조절 서열)를 포함한다. 조직-특이적 프로모터는 요망되는 관심 조직 예컨대, 근육, 뉴런, 뼈, 피부, 혈액, 특정 기관(예를 2021/250511 ?01/162021/054848 들어, 간, 췌장), 또는 특정 세포 유형(예를 들어, 림프구)에서 주로 발현을 지시할 수 있다. 조절 요소는 또한 조직 또는 세포-유형 특이적일 수 있거나 아닐 수 있는 세포-주기 의존성 또는 발달 단계-의존적 방식과 같은 일시적-의존적 방식으로 발현을 지시할 수 있다. 경우에 따라서 벡터는 하나 이상의 po\ III 프로모터, 하나 이상의 po\ II 프로모터, 하나 이상의 po\ I 프로모터, 또는 이들의 조합을 포함한다. po\ III 프로모터의 예는 비제한적으로 및 111 프로모터를 포함한다. ^0\ II 프로모터의 예는 비제한적으로, 레트로바이러스 라우스 육종 바이러스(1½\0 1그¾ 프로모터(임의로 RSV 인핸서를 가짐), 사이토메갈로바이러스(0 \0 프로모터(선택적으로 인핸서를 가짐)(예를 들어, : 此 (1985) 0611 41:521-

530), SV40 프로모터 , 디하이드로폴레이트 환원효소 프로모터 , 액틴 프로모터 , 포스포글리세롤 키나제에 ) 프로모터 및 £ 01 프로모터를 포함한다.

"조절 요소”에는 인핸서 예를 들어, 1111 V·!의 1그¾에서

11-1竹 세그먼트; SV40 인핸서; 및 토끼 글로빈의 엑손 2 및 3 사이의 인트론 서열 등이 포함될 수 있다. 발현 벡터의 디자인은 형질전환될 숙주세포의 선택, 요망되는 발현 수준 등과 같은 인자에 좌우될 수 있음이 당업자에 의해 인식될 것이다. 벡터는 숙주세포 내로 도입되어 본원에 기재된 바와 같은 핵산에 의해 인코딩되는 융합 단백질 또는 펩티드를 포함하는 전사물, 단백질 또는 펩티드를 생성할 수 있다(예를 들어 , 클러스터링된 규칙적 간격의 짧은 회문 반복부 묘犯모幻 전사물, 단백질, 효소, 이의 돌연변이체, 이의 융합 단백질 등). 유익한 벡터는 렌티바이러스 및 아데노-관련 바이러스를 포함하고, 이러한 벡터의 유형은 또한 특정 유형의 세포를 표적화하기 위해 선택될 수 있다.

"폴리뉴클레오티드”, ”뉴클레오티드", ”뉴클레오티드 서열”, "핵산” 및 "올리고뉴클레오티드’’는 상호교환적으로 사용된다. 임의의 길이의 뉴클레오티드의 폴리머 형태, 데옥시리보뉴클레오티드 또는 리보뉴클레오티드, 또는 이들의 유사체를 포함할 수 있다. 폴리뉴클레오티드는 임의의 3차원 구조를 가질 수 있으며, 공지된 또는 비공지된 임의의 기능을 수행할 수 있다. 폴리뉴클레오티드는 하나 이상의 변형된 뉴클레오티드 예컨대, 메틸화된 뉴클레오티드 및 뉴클레오티드 유사체를 포함할 수 있다 . 뉴클레오티드 구조에 대한 변형은 폴리머의 어셈블리 전 또는 후에 가능할 수 있다. 벡터는 원핵 세포 또는 진핵 세포에서 본 발명에 따른 핵산절단효소 (예를 들어, 핵산 전사물, 단백질 또는 효소) 및 절단인자의 발현을 위해 설계될 수 있다. 예를 들어, 핵산절단효소 및 절단인자 전사물은 대장균과 같은 박테리아 세포, 곤충 세포(바큘로바이러스 발현 벡터 사용), 효모 세포, 또는 포유류 세포에서 발현될 수 있다. 경우에 따라서, 재조합 발현 벡터는 예를 들어, T7 프로모터 조절 서열 및 T7 중합효소를 사용하여 시험관 내에서 전사되고 번역될 수 있다. 벡터는 원핵 생물에서 도입되고 증식될 수 있다. 일부 구현예에서, 원핵생물은 진핵 세포 내로 도입될 벡터의 복사체를 증폭시키기 위해 또는 진핵 세포로 도입될 벡터의 생성에서 중간 벡터로서 사용될 수 있다(예를 들어, 바이러스 벡터 패키징 시스템의 일부로서 플라스미드를 증폭시킴). 원핵생물은 벡터의 복사물을 증폭시키고 하나 이상의 핵산을 발현시키며, 예를 들어 숙주세포 또는 숙주 유기체로 전달하기 위한 하나 이상의 단백질의 공급원을 제공하기 위해 사용될 수 있다. 원핵생물에서의 단백질의 발현은 항상 또는 유도성 프로모터를 포함하는, 벡터를 갖는 대장균에서 수행될 수 있다. 상기 벡터는 각각 전기천공법 (electroporation), 리포펙션, 바이러스 벡터, 나노파티클 (nanoparticles) 뿐만 아니라, PTD(Protein translocation domain) 융합 단백질 방법 등을 통해 생체 내 또는 세포 내로 전달될 수 있다. 벡터의 성분으로는 일반적으로 다음 중의 하나 이상이 포함되지만, 그에 제한되지 않는다: 신호 서열, 복제 기점, 하나 이상의 마커 유전자, 증강인자 요소, 프로모터, 전사 종결 서열 등. T-세포 수용체를 코딩하는 핵산은 프로모터 및 전사 종결 서열 등과 같이 작동적으로 연결되어 있다.

"작동적으로 연결’’은 핵산 발현조절서열(예: 프로모터, 시그널 서열 또는 전사조절인자 결합 위치의 어레이)과 다른 핵산 서열 사이의 기능적인 결합을 의미하며, 이에 따라 상기 조절서열은 상기 다른 핵산 서열의 전사 및/또는 해독을 조절하게 된다. 본 발명은 다른 관점에서, 상기 T-세포 수용체를 발현하는, T 세포에 관한 것이다. 상기 T 세포는 배양된 T 세포, 예를 들어 일차 T 세포와 같은 모든 T 세포 또는 배양된 세포주 예를 들어 Jurkat, SupTl 등으로부터 유래한 T 세포 또는 포유동물에서 얻어진 T 세포, 바람직하게는 인간 환자로부터의 T 세포나 T 세포 전구체일 수 있다. 포유동물로부터 얻는 경우, T 세포는 다수의 출처로부터 얻을 수 있으며 혈액, 골수, 림프절, 흉선 또는 기타 조직이나 유체가 포함되지만 이에 제한되지는 않는다. T 세포는 또는 보강하거나 정제할 수 있다. 바람직하게는, T 세포는 인간 T 세포이다. 보다 바람직하게는, T 세포는 인간으로부터 분리된 T 세포이다. T 세포는 CD4 양성 T 세포; CD8 양성 세포독성 T 림프구 (Cytotoxic T lymphocyte; CTL); gamma-delta T 세포; 종양 침윤 림프구 (Tumor infiltrating lymphocyte; TIL) 및 말초혈액 단핵세포 (Peripheral blood mononuclear cell; PBMC)에서 분리한 T 세포로 구성된 군에서 선택되는 것을 특징으로 할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. T 세포는 제한없는 유형의 T 세포일 수 있고 제한없는 발육 단계일 수 있으며, CD4 양성 및/또는 CD8 양성, CD4 음성 조력 T 세포, 예를 들어 Thl 및 Th2 세포, CD8 양성 T 세포 (예: 세포 독성 T 세포), 종양 침윤 세포 (TIL), 기억 T 세포, 자연 T 세포 등이 포함되지만 이에 제한되지는 않는다. 바람직하게는, T 세포는 CD8 양성 T 세포일 수 있다. 본 발명에 따른 CD8 양성 T 세포의 구체적 구조는 도 5에 나타낸 바와 같다. 상기 T 세포는 림프구로 구체적으로 인간 T 림프구이며 , 바람직하게는 CD4 양성 또는 CD8 양성 T 세포와 같은 T 림프구일 수 있다. 상기 T 세포는 종양 또는 암세포에 특이적인 종양 또는 암 반응성 T 세포일 수 있다. 본 발명에 따르면, MR1 제한적 암 살상 CD8+ T 림프구 (MR1 -restricted cancer killing CD8+ T lymphocytes)를 제공할 수 있다. 상기 MR1 제한적 암 살상 CD8+ T 림프구의 구체적 분리 및 대량 배양 방법은 도 1에 나타낸 바와 같다. 또한, 본 발명에 따른 범용 암에 대한 살상능을 가지는 CD8 양성 T 세포를 생산하는 플랫폼 기술에 대한 구체적 모식도는 도 6에 나타낸 바와 같다. 본 발명은 다른 관점에서, 상기 T-세포 수용체, 상기 핵산, 상기 벡터 또는 상기 T 세포를 포함하는 항-종양 또는 항암 조성물에 관한 것이다. 본 발명에 있어서, “암,,과 “종양”은 동일한 의미로 사용되며, 전형적으로 조절되지 않은 세포 성장/증식을 특징으로 하는 포유동물의 생리학적 상태를 지칭하거나 의미한다. 본 발명의 조성물로 치료할 수 있는 암 또는 암종은 특별히 제한되지 않으 며, 고형암 및 혈액암을 모두 포함한다. 예를 들어, 급성 림프구성 암, 급성 골수성 백혈병, 포상 횡문근육종, 골암, 뇌암, 유방암, 항문의 암, 항문, 항문관 또는 직장항 문의 암, 눈의 암, 간내 담관의 암, 관절의 암, 목, 방광 또는 흉막의 암, 코, 비강 또 는 중이의 암, 구강의 암, 질의 암, 외음부의 암, 만성 림프구성 백혈병, 만성 골수 암, 결장암, 식도암, 자궁경부암, 위장관계 카르시노이드 종양, 신경아교종, 호지킨 림프종, 하인두암, 신장암, 후두암, 간암, 폐암, 악성 중피종, 흑색종, 다발성 골수종, 비인두암, 비호지킨 림프종, 구인두의 암, 난소암, 음경의 암, 췌장암, 복막, 장막 및 장간막 암, 인두암, 전립선암, 직장암, 신장암, 피부암, 소장암, 연조직암, 위암, 고환 암, 갑상선암, 자궁의 암, 요관암 및 방광암 중 어느 하나를 포함할 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. 본 발명의 치료용 조성물은 암의 예방 또는 치료를 위한 조성물로서, 본 발명의 용어, “예방”은 본 발명의 조성물의 투여로 암을 억제시키거나 진행을 지연시키는 모든 행위를 의미하며, “치료”는 암의 발전의 억제, 증상의 경감 또는 제거를 의미한다. 상기 조성물에는 T-세포 수용체를 발현하는 T세포의 수가 치료 대상 내의 종양 세포 수의 0.1 내지 30배, 구체적으로 0.2 내지 25배, 더욱 구체적으로 0.25배 내지 20배로 포함되는 것이 바람직하지만, 이에 한정되는 것은 아니다. 상기 조성물에는 약제학적으로 허용되는 부형제가 추가적으로 포함될 수 있다. 그러한 부형제의 예로는, 계면활성제, 바람직하게는 폴리소르베이트 계열의 비이온성 계면활성제; 중성 완충 염수, 인간염 완충 염수 등의 완충제; 글루코스, 만노스, 수크로스 또는 텍스트란, 만니톨 등의 당 또는 당알콜류; 글리신, 히스티딘 등의 아미노산이나 단백질 또는 폴리펩티드; 항산화제; EDTA 또는 글루타티온 등의 킬레이트제 예컨대; 침투제; 보조제; 및 보존제가 포함될 수 있지만, 이에 한정되는 것은 아니다. 본 발명의 조성물은 인간을 제외한 포유동물에 투여된 후 활성 성분의 신속, 지속 또는 지연된 방출을 제공할 수 있도록 당업계에 공지된 방법을 사용하여 제형화될 수 있다. 제형은 분말, 과립, 정제, 에멀젼, 시럽, 에어로졸, 연질 또는 경질 젤라틴 캅셀, 멸균 주사용액, 멸균 분말의 형태일 수 있다. 상기 약학 조성물은 경구 또는 비경구의 여러 가지 제형일 수 있다. 제제화할 경우에는 보통 사용하는 중진제, 증량제, 결합제, 습윤제, 붕해제, 계면활성제 등의 희석제 또는 부형제를 사용하여 조제된다. 경구투여를 위한 고형제제에는 정제, 환제, 산제, 과립제, 캡슐제 등이 포함되며, 이러한 고형제제는 하나 이상의 화합물에 적어도 하나 이상의 부형제 예를 들면, 전분, 탄산칼슘, 수크로오스 (sucrose) 또는 락토오스 (lactose), 젤라틴 등을 섞어 조제된다. 또한 단순한 부형제 이외에 스테아린산 마그네슘, 탈크 등과 같은 윤활제들도 사용된다. 경구투여를 위한 액상제제로는 현탁제, 내용액제, 유제, 시럽제 등이 해당되는데 흔히 사용되는 단순 희석제인 물, 리퀴드 파라핀 이외에 여러 가지 부형제, 예를 들면 습윤제, 감미제, 방향제, 보존제 등이 포함될 수 있다. 비경구투여를 위한 제제에는 멸균된 수용액, 비수성용제, 현탁제, 유제, 동결건조제제, 좌제가 포함된다. 비수성용제, 현탁용제로는 프로필렌글리콜 (propylene glycol), 폴리에틸렌 글리콜, 올리브 오일과 같은 식물성 기름, 에틸올레이트와 같은 주사 가능한 에스테로 등이 사용될 수 있다. 좌제의 기제로는 위텝솔 (witepsol), 마크로골, 트원 (tween) 61, 카카오지, 라우린지, 글리세로젤라틴 등이 사용될 수 있다. 본 발명은 상기 T-세포 수용체, 핵산, 벡터 또는 T 세포를 개체에 투여하는 단계를 포함하는 종양 또는 암 치료방법에 관한 것이다. 본 발명은 또한, 종양 또는 암 치료를 위한 상기 T-세포 수용체, 핵산, 벡터 또는 T 세포의 용도에 관한 것이다. 본 발명은 더욱이, 종양 또는 암 치료용 약제 제조를 위한 상기 T-세포 수용체, 핵산, 벡터 또는 T 세포의 사용에 관한 것이다. 상기 대상체는 종양을 가진 포유류일 수 있으며, 구체적으로는 인간일 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다. 상기 조성물은 경구투여, 주입 (infusion), 정맥내 투여 (intravenous injection), 근육내 투여 (irrtramuscular injection), 피하 투여 (subcutaneous injection), 복강내 투여 (intraperitoneal injectoon), 직장내 투여 (Intrarectal administration), 국소 투여 (topical administration), 비내 투여 (intranasal injection) 등으로 투여될 수 있지만, 이에 한정되는 것은 아니다. 활성 성분의 투여량은 투여 경로, 환자의 연령, 성별, 체중 및 환자의 중증도 등의 여러 인자에 따라 적절히 선택될 수 있고, 상기 조성물은 종양 또는 암 증상을 예방, 개선 또는 치료하는 효과를 가지는 공지의 화합물과 병행하여 투여할 수 있다. 이하, 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다. 이들 실시예는 오로지 본 발명을 예시하기 위한 것으로서, 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되는 것으로 해석되지 않는 것은 당업계에서 통상의 지식을 가진 자에 있어서 자명할 것이다. 제한적 1세포의 분리 흑색종 (쇼375), 유방암 (SKOV-3), 대장암 세포주 (8\¥480, ^1- 15) 등에서 낮은 수준으로 발현됨을 확인하였다 (도 2). 증식 다이 (Proliferation dye) 기반으로 MR1-제한적 T 세포 (MR1 -restricted T cell)를 분리 및 증식하였다. 2명의 건강한 기증자 PBMC를 조사된 SW480 세포 (irradiated SW480 cells)와 공배양하여 자극한 후, 게이트화된 CD3 + CFSElow 세포 (gated CD3+CFSE low cells)에서 CD8+CD4 - T 세포를 분리하였다. 분리된

CD3 + CD8 + CFSE low 세포를 급속 확장법 (rapid expansion me仕 iod)을 이용하여 대량 증식 시켰다 (도 3a). 건강한 기증자 PBMC를 조사된 SW480 세포와 공배양하였다. 조사된 SW480 세포로 재자극 (re-stimulation) 전과 후에 MR1-제한적 CD8+ T 세포에서 4-1BB 발현 을 확인하였다. SW480 세포에 재자극하기 전에는 CD8+ T 세포에서 4-1BB의 발현이 검출되지 않았지만, 재자극한 후에는 4-1BB 발현이 검출되었다 (도 3b). 건강한 기증자 PBMC를 조사된 SW480 세포와 공배양하여 자극한 후, 게이트 화된 CD3 + CFSElow 세포에서 4-1BB + CD8 + T 세포를 분리하였다. 분리된 4-1BB + CD8 + T 세포는 급속 확장법을 이용하여 대량 증식되었다 (도 3c). 실시예 2. MR1 제한적 T세포는 MAIT 세포와 상이한 암을 인지함

MAIT 세포 (Mucosal-associated invariant T cell)는 말초 혈액 T 세포의 약 1~8%, 점막조직, 장간막 림프절, 간에 존재하는 T cell의 약 40%를 구성하며, MR1을 통해 비펩타이드 항원 (nonpeptidic Ag)을 인식하는 것으로 알려져 있다. MAIT 세포에 인지 되는 항원은 박테리아 및 진균에 의해 생성된 리보플라빈 유도체 (riboflavin- derivatives), 특히 5-OP-RU (5-(2-oxopropylideneamino)-6-d-ribitylaminouracil)이며, TCR V a7.2 + CD161 Mgh 표현형을 가진다.

SW480 세포에 의해 자극된 MR1 제한적 T 세포와 함께, MR1 테트라머 엠프 티 (MR1 tetramer-empty) 및 MR1 테트라머 로딩된 5-OP-RU로 염색하였다. SW480 세 2021/250511 ?01/162021/054848 포과 함께 배양하여 자극한 후, 분리된 제한적 I 세포를 쇼押 세포에 대한

1 111 리간드인 5-01^10; 테트라머로 염색하였을 때, 5-0?^ 테트라머에 결합하지 않았다 (도 4句 이를 통해, 선별된 제한적 I세포는 쇼押세포가 아님을 확인 하였다. 8\^480 세포에 의해 자극된 제한적 I세포에 의한 1 10八¾7.2 + 0)161 1 11 에 대한 표현형을 분석하였다. 8\^480 세포과 함께 배양하여 자극한 후, 분리된 1 111 제한적 I세포에서 1 10八¾7.2와 0)161이 이중 염색되지 않음을 통해 선택된 1 111- 제한적 I세포는 세포가 아님을 확인하였다. 또한, Va7.2-CD161 - 분획의 제한적 I세포에서 4 - 166 발현이 확인되었다(도此). 실시예 3.101 발현 ^ 세포의 암 살상능 확인

3.1 렌티바이러스 형질감염 플라스미드 제작

1 111 10^1 세포 제작을 위한 렌티바이러스 형질감염 플라스미드 클로닝을 진행하였다. 세포를 위해 제작한 렌티바이러스 형질감염 플라스미드 구 조는 도 7과 같다. 렌티바이러스 형질감염 플라스미드 클로닝을 위한 벡터 백본을 아 발현시킬 수 있는 구조이다.

3.2 유전자 합성 클론에 대한 알파 체인 및 베타 체인 서열 정보를 토대로 유전자 를 합성하였다. 유전자 서열 정보는 다음 표 1과 같다. [i£ 1]

[i£ 2]

[i£ 3] 2021/250511 1^(:1^2021/054848

3.3 Competent cell인 S仕 )1 III을 이용하여 클로닝 벡터 백본인 pELPS3-TRBC-P2A-eGFP의 구조체 내부에 있는 제한효소인 Bam HI, BstB I을 이용하여 벡터를 선형화 (linearization) 하였다. 합성한 MR1 TCR은 삽입 물 (insert)로서 동일한 제한효소 처리 꾸 벡터와 라이게이션 (ligation) 하였다.

3.4 클로닝 결과 클로닝한 렌티바이러스 형질감염 플라스미드의 구조 분석을 위해 적정 효소 를 선정하였고, 이에 대한 결과는 도 9에 정리하였다. 또한, 플라스미드에 대한 시퀀 싱을 진행하였다 [Macrogen, Order No. HC00246947, HC00256796, HC00257025]. 시퀀싱 결과, 제작한 플라스미드의 염기서열에 문제가 없음을 확인하였다 . 실시예 4. MR1 TCR-Jurkat-NFAT-Luc 제작 및 역가시험 4.1 렌티바이러스 생산 클로닝한 렌티바이러스 형질감염 플라스미드와 렌티바이러스 패키징 플라스 미드 3종을 Lipofectamine 3000 형질감염 제제로 Lenti-X 293 세포에 형질감염하여 렌 티바이러스를 생산하였다.

4.2 형질도입 (Transduction)

Protamine sulfate( 10 mg/mL)를 10% FBS RPMI 배양액에 농도 10 y g/mL이 되도 록 희석하여 준비하였다. Jurkat-NFAT-Luciferase의 세포 수를 즉정하였다. 세포 농도 2 X 10 6 cells/mL에 맞주어 희석 protamine sulfate 배양액으로 재서스펜션 (resuspension) 하 였다. 6 웰 플레이트에 세포 혼합액을 well당 1.5 mL씩 넣었다. 생산한 바이러스 500 U L 넣었다. 25 ° C, 1200g, 2시간 조건으로 원심분리하였다 (Spinoculation). 원심분리가 끝난 후 웰당 배약액 1.5 mL 추가하여 37 ° C, 5% C02 lncubator에서 배양하였다.

4.3 발현 확인을 위한 FACS 분석 Jurkat-NFAT-Luciferase에서의 TCR 발현 확인을 위해 태그된 단백질 (Tagged protein)인 GFP의 발현을 확인하고자 FACSCelesta를 이용하여 FACS 분석을 시행하였 다.

4.4 역가시험 (Luciferase based assay) Effector T cell (MR1 TCR-Jurkat-NFAT-Luc)을 수확하여 세포수를 측정하였다.

1500 rpm에서 5분간 원심분리하였다. 상증액 제거 꾸, 세포 농도가 4.0 x 10 5 cells/mL이 되도록 배양액을 주가하여 재서스펜션 (resuspension) 하였다. 타겟 세포 (MR1 overexpressed A375)을 수확하여 세포수를 즉정하였다. 1500 rpm, 5분 조건으로 원심분리하였다. 상층액 제거 후, 세포 농도가 4.0 x 10 6 cells/mL이 되도록 배양액을 추가하였다. 2021/250511 1^(:1^2021/054848 타겟 세포를 E:T ratio 에 맞추어 3 -배 연속 희석하였다 (duplicate). 96 웰 White Flat bottom Assay Plate에 타겟 세포를 75 y L八 veil (effector (E) : target (T) ratio = 1:10)을 넣고 멀티를 파이팻 (multipipette)을 이용하여 E:T ratio = 1:0.3 까지 3 -배 연속 희석하 였다. 웰 당 이펙터 T 세포 (effector T cell) 희석액을 50 씩 넣었다 (2.0 x 10 4 cells/well). 이펙터 T 세포만 들어가는 음성대조군 (negative control group)의 웰에는 배 양액 50 u L 넣었다.

37 ° C, 5% CO2 incubator에서 4시간 공배양 하였다. 4시간 배양 후, Bright-Glo™ Luciferase Assay reagent를 넣고 5분간 반응시킨 꾸, Luminometer를 이용하여 발광을 즉 정하였다. Target cell대신 배양액을 넣어 Activation 시키지 않은 group을 Negative control 로 하여 luminescence 값의 Fold 값을 계산하였다.

Luminescence of co — culrured cell with target cell

Luminescence Fold ¾c = - : - : - - r — 71 -

Luminescence of unactivated cell

4.5 Jurkat-NFAT-Luciferase에서의 TCR 발현 확인 결과 클론 모두 Jurkat에서 바이러스에 의한 TCR 발현이 확인되었다. 단, 동일 바 이러스 볼륨을 처리하였기에 실제 이는 클론마다 달랐다 (도 10).

6.6 역가 측정 결과 생산된 MR1 TCR-Jurkat-NFAT-Luciferse를 이펙터 세포 (effector cell)로 이용하고 A375-MR1 cell line을 타겟 세포로 하여 Luciferase based functional assay를 수행하였으며, 그 결과 레퍼런스 군 (Reference group)인 MC.7.G5 군과 비교하였을 때 EUMR1-03, 14, 31, 32, 36, 37, 38 모두 유사한 수준으로 반응성을 보였으며, EUMR1-33 클론은 월등히 높은 활성을 보였다 (도 11). 2021/250511 ?01/162021/054848 산업상 이용가능성 본 발명은 암종 따른 암항원의 발현에 따라 제한적으로 사용 되는 기존 맞춤형 항암면역 I세포치료제와 달리, 상관없이 모든 암종에 적용 가능한 ᅡ세포 수용체를 발현하는 I세포치료제로 적용될 수 있다. 이러한 111 I세포는 정상세포를 공격하지 않고 암세포만을 선택적으로 공격할 수 있는 능 력이 있어, 부작용없이 항암효과가 증대될 것이며, 기존 다양한 치료제들과 병용치 료에서도 시너지가 발휘될 수 있다. 이상으로 본 발명의 내용의 특정한 부분을 상세히 기술하였는바, 당업계의 통상의 지식을 가진 자에게 있어서, 이러한 구체적 기술은 단지 바람직한 실시양태 일 뿐이며, 이에 의해 본 발명의 범위가 제한되는 것이 아닌 점은 명백할 것이다. 따라서, 본 발명의 실질적인 범위는 첨부된 청구항들과 그것들의 등가물에 의하여 정의된다고 할 것이다.